Nature 论文被指 “翻车”,新冠 mRNA 疫苗研究因实验、假设、分析问题遭网友炮轰

Research Integrity2025-05-02 10:36:47美国


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近日,一项关于新冠 mRNA 疫苗的研究引发关注与争议。该研究由 Pawe? S. Krawczyk 等众多科研人员完成,相关成果于 2025 年 4 月 16 日以 “Re - adenylation by TENT5A enhances efficacy of SARS - CoV - 2 mRNA vaccines” 为题,在线发表于《Nature》杂志(doi: 10.1038/s41586 - 025 - 08842 - 1 )。


研究指出 TENT5A 的重新腺苷酸化可增强 SARS - CoV - 2 mRNA 疫苗的功效。然而,网友 “Holothuria mexicana” 对此提出诸多质疑。首先,在实验方法上,研究使用纳米孔测序测量 poly (A) 尾长度存在问题。纳米孔测序因 poly (A) 尾由重复腺苷核苷酸组成,产生的电信号非线性且嘈杂,难以准确测量,尽管研究团队开发了定制方法补偿,但仍未解决根本问题,如电信号测量中固有的误差来源既未解决,也未量化。并且在测量准确性、方差,以及与独立方法对比等方面都未提及。


其次,关于重新腺苷酸化等同于 poly (A) 尾长度这一假设,网友认为不合理。多种因素可控制 poly (A) 尾长度,若 poly (A) 尾上游信号基序稳定,即便无实际尾延长效果,也可能暗示重新腺苷酸化,因此这一假设存在严重方法冲突。


再者,在数据分析方法上,研究团队在确定差异基因表达时,选择似然比检验(LRT)而非更合适的 Wald 检验,且未给出合理理由。同时,选择巨噬细胞系(mBMDMs)进行研究,而该细胞系中 TENT5A 表达最强,与后续指出的 TENT5A 在树突状细胞(DCs)中表达显著较低情况不符,这可能导致结果偏向产生人为的强 p 值。


另外,网友还指出研究中的多个图表存在矛盾。如 Figure 1e 中 TCTAG + poly (A) 尾基序与纯 poly (A) 基序无相关性;Figure 3d 因使用 LRT 影响结论可靠性;Figure 4c 中 TENT5 沉默时 TCTAG + poly (A) 基序读取计数增加等。并且在之前的研究中,该团队也曾承认 poly (A) 尾存在多种修饰情况。综合来看,网友认为该研究将 mRNA 稳定和读取恢复归因于 TENT5 缺乏足够生物学合理性和方法学支持。

https://pubpeer.com/publications/A460C6C269ED9D3B7A96C11D15AFA3#0



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