重磅！知名二级教授课题组多篇1区Top文章受质疑

文章的第一作者：Yu Feng（冯雨，音译）；

文章的通讯作者：YUECHUN ZHU（朱月春，音译）

PubPeer论坛披露，来自昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系朱月春课题组发表在中科院1区Top期刊communications biology的文章被广泛质疑，其中涉及多条Western blot条带的重复使用，为不同曝光强度调整后的图像。

与此同时，多个学术网站指出该课题组发表在中科院1区Top期刊Cell Death and Disease的文章存在严重的学术争议。作者在Figure 6中指出：NOD2过表达和敲低能够负向调控TYMS的蛋白水平变化。Figure 7A-C中的0小时的实验结果，不同组间的变化差异应该与Figure 6G相一致。然而，作者却根据其他文章中的线性统计结果，错误的理解为0小时不同组间的蛋白水平应该是一样的。根据NOD2对下游因子PLK1和TYMS（实际相关性低），尤其是TYMS的调控，不论是转录水平还是蛋白水平，均值得怀疑。尤其是蛋白水平调控的数据呈现（Figure G和图7A-C），更是严重错误。

作者有意回避了本文中诸多关键问题的探讨，这些问题是支撑论文结论所必需的。此外，作者没有提及这些明显的实验数据，而是只选取了符合其预期结果的有利实验数据进行呈现。例如，在图2和图3中，作者展示了功能性表型相关因素的 mRNA 水平检测结果，但在图4和图5中却没有这样的结果。我们有理由怀疑 mRNA检测结果与他们的预期不符或者与蛋白质水平检测结果不一致。然而，无论结果如何，作者都应该给出解释。然而，在查阅整篇文章和补充材料后，根本未提及这一问题。这就引发了疑问：作者是忘记提供这些数据还是有意隐瞒了它们？

这篇文章中没有给出转录组学的材料方法说明，然而这一环节却是本文由功能表型转向机制研究的关键环节。在本文中虽然作者通过转录组测序技术指出NOD2过表达与细胞周期相关，但具体分子机制的关键因子PLK1和TYMS 的引出却是利用了参考文献33和34.作者并没有指出在转录组测序中可见以上两个因子表达具有显著变化。作者在Figure 8A中指出PLK1和TYMS具有一定相关性。事实上，通过TCGA数据分析发现不论是NOD2与PLK1的相关性，还是NOD2和TYMS的相关性均很低。但作者却故意不提供这一显而易见的数据。据此，我们强烈怀疑这两个因子在转录组测序中有可能并未检测到，或者根本就没有变化，或者与预期不一致。为了证实这一推测，读者试图通过转录组原始数据加以证实，但却发现作者并未将这些数据上传到公共数据库，甚至在材料方法中对这一实验居然没有任何描述。

另外，由于作者不理解蛋白稳定性相关研究技术中的定量CO-IP实验技术原理与依据，致使其在Figure 7D-F的结果呈现中TYMS的条带不一致，既不是同Figure 6F-G中的NOD2负调控TYMS，更不是理论中的TYMS条带粗细应该一致，代表该因子的检测量一致。在Figure 7D-F的结果中，作者呈现的结果毫无规律可言，并且错误，对读者造成了极大误导，该错误结果不足以得出本文中“NOD2 inhibits thymidylate synthase (TYMS) expression by promoting K48-type ubiquitination modification of TYMS”这一结论。

同时，作者指出 “With the prolongation of 5-FU treatment, FdUMP-TYMS gradually increased, while Free-TYMS significantly decreased before 48 h and then increased after 48 h. The expression of PLK1 and p-PLK1 was also downregulated after 5-FU treatment (Fig. 8C), suggesting that PLK1 is a downstream effector molecule of TYMS, and TYMS positively regulates the expression and activity of PLK1.”。然而，单由此一个结果并不能说明TYMS是正调控PLK1，因为PLK1并没有随着TYMS表达量的增加而升高。这一结论描述过于武断，如同药物协同性一样，根本没有数据支撑，反而是所呈现的数据与给出的结论相反。

除了上述严重性错误，本文还有很多不止上述所示的图片质量问题，如图片重叠、中英文字体混用等粗制滥造问题。据此，读者怀疑该文可能涉及公司或评审过程操纵。除此以外，没有任何理由相信这篇错误众多的文章能够在短时间内发表在学术声望如此高的CDD期刊。鉴于此，读者对该课题组前期发表的成果进行了检索。发现该文的通讯作者甚至存在因学术不端而被撤稿的一篇文章（Retracted: Long Noncoding RNA SAMMSON Promotes Melanoma Progression by Inhibiting FOXA2 Expression. [This retracts the article DOI: 10.1155/2023/8934210.].）

以上两篇文章受到多项国家自然科学基金项目资助，建议相关部门严查！