学术打假聚焦南京市第一医院，党委书记 28 分论文现重复疑云

本文中提到的以下核苷酸序列试剂似乎被错误地识别了：

1. qRT-PCR 正向引物 5'- CAACCTTCGGAAAAGCAGATG -3'

• 声称靶向人类 ANKS1B （chr12：98,726,457-99,984,936（GRCh38/hg38））
• 预测在人类中是非靶向的。

1. qRT-PCR 反向引物 5'- TGGTGCCCGTAAGTGCAGAC -3'

• 声称靶向人类 ANKS1B （chr12：98,726,457-99,984,936（GRCh38/hg38））
• 预测靶向人 PLIN4 （chr19：4,502,192-4,518,486（GRCh38/hg38））

1. siRNA 5'- GGCTCCTTAAAGAAACGCT-3'

• 声称靶向人类 MEX3B （chr15：82,041,778-82,046,119（GRCh38/hg38））
• 预测在人类中是非靶向的。
• 预计靶向其他物种中的 MEX3B，包括 Mirounga、leonine 和 Pan paniscus。

1. qRT-PCR（后 RNA 免疫沉淀）正向引物 5'- TGATTTTGCCCAACACTAGG-3'

• 声称靶向人类 ESRP1a （chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测在人类中是非靶向的。

1. qRT-PCR（RNA 免疫沉淀后）反向引物 5'- AGATCGCACCACTGCACTC-3'

• 声称靶向人类 ESRP1a （chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测靶向人类LOC105377223 （chrY：19,455,431-19,567,092（GRCh38/hg38））

1. qRT-PCR（后 RNA 免疫沉淀）正向引物 5'- TCCCAAAGTGCTGGGATTAC-3'

• 声称靶向人 ESRP1b （chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测靶向人 CDR1 （chrX：140,772,083-140,793,212 （GRCh38/hg38）

1. qRT-PCR（RNA 免疫沉淀后）反向引物 5'- AAATATCATCCTGGCCCTCA-3'

• 声称靶向人 ESRP1b （chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测靶向人 LY6G6F-LY6G6D （chr6：31,706,866-31,717,919（GRCh38/hg38））

1. qRT-PCR（RNA 免疫沉淀后）正向引物 5'- TGTCTTTGCCAGTTCAGTGTG-3'

• 声称靶向人类 ESRP1c （chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测在人类中是非靶向的。

1. qRT-PCR（RNA 免疫沉淀后）反向引物 5'- ACTGCGAGTAAAACCCCAAA-3'

• 声称靶向人类 ESRP1c （chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测在人类中是非靶向的。

1. qRT-PCR（后 RNA 免疫沉淀）正向引物 5'- TTAGGAATGAGAGTTTACAAAGA-3'

• 声称靶向人类 ESRP1d （chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测在人类中是非靶向的。

1. qRT-PCR（RNA 免疫沉淀后）反向引物 5'- GTTTTTCTTGCTTTTGTGTTCA-3'

• 声称靶向人类 ESRP1d（chr8：94,641,074-94,707,466（GRCh38/hg38））
• 预测以人类LOC107984425为目标 （chr11：83,545,490-83,572,181（GRCh38/hg38））

本文中提到的以下核苷酸序列试剂的身份无法验证：

1. qRT-PCR 正向引物 5'-CGGACCCACACTGAGTTTACC-3'

• 声称以人类 circSnail 为目标
• 在 CircPRIMER 上查询正向和反向引物未发现人 circRNA 靶标
• 研究未鉴定特异性 circRNA，也未披露反向剪接连接位置。
• 预测在人类中为非靶向

1. qRT-PCR 反向引物 5'- TCCCAGATGAGCATTGGCAG-3'

• 声称以人类 circSnail 为目标
• 在 CircPRIMER 上查询正向和反向引物未发现人 circRNA 靶标
• 研究没有确定特定的 circRNA，也没有揭示反向剪接连接的位置
• 预测靶向线性宿主基因 Snail （chr20：49,982,980-49,988,886（GRCh38/hg38））

1. qRT-PCR 正向引物 5'- GTGCTCAACCAGTTGGCACC-3'

• 声称靶向人类 circGAPDH
• 在 CircPRIMER 上查询正向和反向引物未发现人 circRNA 靶标
• 研究未鉴定特异性 circRNA，也未披露反向剪接连接位置。
• 预测在人类中为非靶向

1. qRT-PCR 反向引物 5'-AGCCTCGCTCCACCTGACTT-3'

• 声称靶向人类 circGAPDH
• 在 CircPRIMER 上查询正向和反向引物未发现人 circRNA 靶标
• 研究未鉴定特异性 circRNA，也未披露反向剪接连接位置。
• 预测靶向线性宿主基因 GAPDH （chr12：6,534,512-6,538,374（GRCh38/hg38））

这些核苷酸序列的身份按所述进行了验证（Byrne 等人，2021 年，Park 等人，2022 年，Pathmendra 等人，2023 年）。我们认识到，核苷酸序列分析依赖于可能会更新的算法和数据库。

这些错误识别的试剂可能仅反映手稿准备过程中发生的错误，或者它们可能反映可能质疑结果有效性的更关键问题。

此评论由 PRIMER 小组撰写。

参考信息：https://pubpeer.com/publications/BE8AF92AFD187E90AFFC91371569FE

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